Questa veniva portata in processione quando le epidemie o le calamità naturali minacciavano la città. Detti Padri restarono per ben 138 anni nella nostra Città, e dovettero abbandonarla nel 1652, avendo il Papa Innocenzo X soppresso i piccoli conventi. Nel 1843 la chiesa venne consacrata dal vescovo Rocco de Gregorio sotto il titolo della Vergine del Soccorso e, con una bolla del 10 settembre 1857, papa Pio IX dichiarò la Madonna “Patrona” della città di San Severo. Ai primi dell’800 ebbe inizio l’usanza della processione in onore della Madonna del Soccorso, la prima domenica di maggio. Dal 1852 partecipò alla processione anche la statua di S. Severo e dal 1908 anche quella di S. Severino, dichiarato “compatrono” della città. L’8 maggio 1937, con l’intervento del cardinale Caccia Dominioni, di molti vescovi e di autorità civili e militari, la Madonna venne incoronata da mons. Oronzo Durante. Nel 1957 la chiesa venne dichiarata Santuario mariano.

L’attuale facciata risalente al XVIII secolo, dopo l’ampliamento seguito al disastroso terremoto del luglio 1627, rappresenta un ottimo esempio di arte barocca ed è stata realizzata dal maestro scalpellino di San Severo Francesco Cervone. Nello stesso periodo fu innalzato il nuovo campanile, la cui costruzione terminò solo nel 1823.